基于表观组信息低成本组装解析生物核心基因组信息
一、项目简介
本发明属于生物组装解析领域。本发明人经过深入的研究,发现基因组的表观遗传修饰的分布特点、丰度适合于与测序技术相配合,获得较为全面的基因组信息。进一步地,本发明人优化了捕获所述表观遗传修饰的方法,即免疫共沉淀技术。利用本发明的方法,能够获得长片段的基因区序列或调控区序列,不依赖于任何已有的序列信息,并且可极大地降低检测成本。
二、专利摘要
本发明涉及基于表观组信息低成本组装核心基因组进而解析生物基因组信息的方法及其应用。本发明提出一种新的获得核心基因组序列信息的方法,首先捕获调控基因活性的单一或多种表观修饰所结合的核酸序列,之后对获得的序列进行建库、测序、拼接、组装等,获得序列信息。本发明的方法能够在没有参考基因组的物种以及遗传差异比较大的品种中获得长片段的基因区序列或调控区序列,而且不依赖于任何已有的序列信息。
三、专利状态
本技术已递交中国专利申请,申请号:201810266892.8,实质审查中;持有人项目编号:SIPPE18-11。
四、持有单位
中国科学院分子植物科学卓越创新中心。
五、合作方式
转让、许可或合作研发。
六、联系方式
张雯,wzhang@cemps.ac.cn,021-54924138。