一种基于Cpf1的DNA构建物以及DNA体外拼接方法

一、项目简介
本技术属于生物医药领域。目前的DNA拼接技术都存在一些不足之处和改进空间,本发明提供了一种DNA构建物,该构建物中包括前缀与后缀(分别为一段能被CRISPR相关酶切割的DNA序列),并且含有结构Ta-C-Tb,式中,Ta为前缀,含有酶切割位点的核酸序列;C为待拼接的核酸序列;Tb为后缀,含有不同于前缀的酶切割位点的核酸序列;其中,前缀和后缀包含的酶切位点(T2与T3)经酶切割后产生同尾序列。
本发明还提供了上述DNA构建物的应用和使用该DNA构建物的一种DNA体外拼接方法:C-Brick标准组装方法。该技术的优点在于(1)由于CIRPSR相关酶,如Cpf1内切酶识别的序列远长于常规的内切酶,多达24个碱基对左右,并且需要PAM序列(TTN),其识别位点在天然DNA序列中非常稀少。因此,在构建C-Brick标准化元件时,基本上不需要进行DNA内部酶切位点的去除,这使得这个技术能够不需要改造原始的序列就能够容纳更大的生物元件,能够直接利用有更好表征的天然序列,极大地减少了标准化生物元件的工作量,增加了这个组装技术中循环组装策略使用的普适性;(2)长的识别序列也为长片段的克隆和拼接提供了单一酶切位点,使得单个生物元件的容量可以大大增加。因此,该技术在长片段DNA序列的标准化、组装和表征等方面具有显著的优点。3)C-Brick拼接可以留下较短的疤痕,如六个碱基的疤痕GGATCC,翻译成氨基酸序列为甘氨酸-丝氨酸,通常情况下,它是可用于融合蛋白的连接肽序列。使用本发明的构建物和方法能够对DNA进行工程化、标准化、模块化的改造或组装。
使用本技术发明人还开发了一种用于细胞基因组的遗传改造和/或用于基因回路的构建的试剂盒。因此,C-Brick标准组装具有巨大的应用前景。


二、专利摘要
本发明提供了一种DNA构建物,所述DNA构建物中包括前缀与后缀,并且所述DNA构建物含有结构Ta?C?Tb,式中,Ta为前缀,含有酶切割位点的核酸序列;C为待拼接的核酸序列;Tb为后缀,含有不同于前缀的酶切割位点的核酸序列;其中,所述前缀和后缀包含的酶切位点(T2与T3)经酶切割后产生同尾序列。本发明还提供了上述DNA构建物的应用和使用该DNA构建物的一种DNA体外拼接方法。使用本发明的构建物和方法能够对DNA进行工程化、标准化、模块化的改造或组装。


三、专利状态
本技术已递交中国专利申请,申请号:201610199930.3 ,已获授权;持有人项目编号:SIBS16-017。


四、持有单位
中国科学院分子植物科学卓越创新中心

五、合作方式
转让、许可或合作研发。


六、联系方式
任老师,021-54924289