2022年8月16日，国际著名学术期刊Proceedings of the National Academy of Sciences（PNAS）在线发表了中科院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所/中科院植物分子遗传国家重点实验室谢芳研究组题为“Constitutive activation of a nuclear-localized calcium channel complex in Medicago truncatula”的研究论文。该研究揭示了在植物-微生物共生互作的共生信号途径中核膜定位的钙离子通道蛋白DMI1和CNGC15协同编码核钙信号的分子机制，为深入理解共生过程钙信号的形成提供了新的见解。

　　钙离子作为一种重要的第二信使，在真核生物多个信号通路中都发挥着重要作用。在豆科植物与根瘤菌或菌根真菌的共生互作过程里，结瘤因子（Nod Factor，NF）或菌根因子（Myc factor，MF）激活的核及核周钙振荡是传递共生信号的核心事件。有效解析共生过程中钙信号的编码机制，相当于解读了钙指纹的密码，能够协助指导植物作出共生响应，对农业生产的可持续发展意义重大。

　　在豆科植物与根瘤菌共生固氮体系中，根瘤作为豆科植物特化的、重要的共生固氮器官，受NF信号途径激活而形成；而细胞核钙振荡作为NF信号的早期响应调控着下游共生基因的表达（Ehrhard et al., 1996）。在蒺藜苜蓿（M. truncatula）中，DMI1与CNGC15是两个定位于核膜的钙离子通道蛋白，参与核及核周钙振荡的形成，而且DMI1还可以与CNGC15相互作用（Charpentier et al., 2016）。然而，共生过程中核钙信号的编码以及DMI1与CNGC15如何调控核钙信号形成的机制尚不清楚。

　　谢芳研究组在蒺藜苜蓿中筛选到一个自发结瘤突变体spd1（spontaneous nodule development 1），即在不接种根瘤菌或NF的情况下植物根部能形成根瘤器官。结合遗传分析和基因定位，发现spd1是一个单基因控制的功能获得性突变体，在离子通道蛋白DMI1的羧基端RCK2结构域第760位丝氨酸发生了错义突变，即DMI1^S760N。遗传实验证明，表达DMI1^S760N在野生型植物中，可以在不接种根瘤菌时形成根瘤器官，验证了spd1的自发结瘤表型确实是由DMI1^S760N的突变导致的。通过植物体内细胞钙成像技术检测，发现细胞核钙振荡信号特异的在spd1根部将要形成根瘤的部位被自发激活。RNA-Seq和qRT-PCR结果进一步表明，由NF及MF信号激活的共生基因在spd1中组成性表达，表明DMI1^S760N作为DMI的功能获得性形式自发激活了共生信号途径。

　　该研究进一步通过结构生物学和遗传学手段阐明DMI1^S760N的功能机制，发现DMI1^S760N没有改变DMI1的核膜定位以及与CNGC15相互作用的能力，但该突变可能破坏了DMI1 RCK结构域界面的分子间作用力，从而导致DMI1通道蛋白呈现为组成性激活形式。研究表明，DMI1^S760N激活自发结瘤和共生基因表达依赖于CNGC15的存在，而且DMI1的钙离子结合及选择性活性是DMI1^S760N激活自发结瘤所必需的。利用HEK 293T细胞的重组表达系统检测了通道蛋白活性，发现只有共表达DMI1^S760N和CNGC15才能促进胞内钙离子的内流，并一定程度地介导有规律的钙离子浓度变化。这种效应依赖于DMI1门环结构上钙离子的结合和选择性位点，以及DMI1和CNGC15的离子通道活性。

　　综上所述，该研究通过对自发结瘤突变体spd1的研究，揭示了植物-微生物共生互作中，钙通道蛋白DMI1激活CNGC15的通道活性进而促进共生核钙振荡形成的分子机制。

　　中科院分子植物科学卓越创新中心谢芳研究组已毕业的博士生刘海月、林杰顺、博士生罗振鹏、张鹏（结构）研究组博士生黄小伟与英国剑桥大学Sainsbury实验室的Jongho Sun博士是该论文的共同第一作者，谢芳研究员是该论文的通讯作者。王永飞研究组博士生杨阳以及谢芳组工作人员徐霁也参与了本研究。该研究工作得到了英国剑桥大学Giles Oldroyd教授、中科院分子植物科学卓越创新中心张鹏研究员、王永飞研究员的大力支持和帮助。该研究得到了中国科学院青年科学家基础研究项目、国家重点研发计划、国家自然科学基金、中国科学院战略重点研究计划以及Bill and Melinda Gates基金会的支持。

　　论文链接: www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.2205920119

植物-微生物共生信号途径中DMI1和CNGC15编码核钙振荡的工作模型